sábado, 18 de marzo de 2023

Empezamos a tener resultados de la segunda tanda de cultivos

Sembrábamos hace unos días una nueva tanda de placas preparadas en la Estación Experimental del Zaidín también con Arabidopsis. La diferencia con los experimentos de la primera tanda es que en esta ocasión los extractos van incluidos en el medio de cultivo mientras que en los primeros se añadieron una vez solidificadas las placas.

Los resultados se muestran a continuación:

Desarrollo de Arabidopsis en la placa control, y en placas con extractos de pimiento de la variedad California Melchor verde y rojo.

Desarrollo de Arabidopsis en la placa control, y en placas con extractos de pimiento de la variedad Alegría riojana verde y rojo.

Desarrollo de Arabidopsis en la placa control, y en placas con extractos de capsaicina 15µM y 125µM.

Desarrollo de Arabidopsis en los controles (agua y medio de cultivo para plantas) y en placas con extractos de Pseudomonas putida y P. stutzeri.








viernes, 10 de marzo de 2023

Primeras medidas y nuevos experimentos

Concluidos los primeros experimentos y una vez pasadas las dos semanas que hemos dejado germinar y crecer las semillas de Arabidopsis es el momento de proceder a medir la longitud de las raíces con el programa Rootnav.  Recordemos que tenemos dos lotes de plántulas, ambas inoculadas en la EEZ, unas crecidas allí también y las otras en nuestro laboratorio.

Entre las actividades del proyecto hemos empezado a medir las raíces de Arabidopsis con los distintos tratamientos con el programa Rootnav. Una vez medidas comenzaremos con los análisis estadísticos. 


Paralelamente hemos iniciado una nueva tanda de cultivos. En este caso, las placas se han preparado en la EEZ, y a diferencia de las anteriores, en las que se añadieron los tratamientos al agar una vez gelificado, en este caso se han incorporado al propio medio. Y del mismo modo habrá dos lotes, uno de los cuales cultivaremos en el laboratorio.

Carolina, Elsa y Lucía se encargaron de sembrar las nuevas placas también con nuevas semillas de arabidopsis.

 

¿Nos van diciendo algo los análisis preliminares de los resultados que estamos obteniendo? ¿Se nos está planteando algún problema con la medida de las plántulas? Es el momento de compartir las experiencias en los comentarios del blog.

domingo, 5 de marzo de 2023

Comenzamos los análisis de resultados

Ya tenemos los resultados de la primera fase de nuestro proyecto, tanto de los cultivos que crecimos en nuestro laboratorio preparados en la Estación Experimental del Zaidín, como los que se han desarrollado completamente allá. Hemos dejado crecer quince días a nuestras plántulas de Arabidopsis y es ahora el momento de proceder a sus medidas.

Vamos a medir la longitud de las raíces con el programa Rootnav, una aplicación de software libre cuya aplicabilidad se describe en el artículo al que se puede acceder desde este enlace. Las instrucciones de uso del mismo se encuentran en esta dirección a la que también se puede acceder desde la carpeta de recursos.

Desde los enlaces siguientes o desde la pestaña de recursos podemos acceder a las carpetas con las imágenes. Es ahora momento de ponernos de acuerdo en cuáles vamos a analizar cada uno de nosotros y de ir compartiendo los resultados que obtengamos.

 

jueves, 2 de marzo de 2023

Nuestras placas, 2 de marzo de 2023

Tras los días sin clase del puente, nos encontramos nuestros cultivos como se muestra en las imágenes de abajo. Un dato a tener en cuenta para interpretar el estado de las mismas es que no hemos venido al instituto durante los cinco días festivos. Y eso puede ser importante en cuanto a lo que se ha comentado en las entradas anteriores respecto a factores como la concentración de dióxido de carbono o la distinta cantidad de luz al haber clase en el laboratorio o la ausencia de calefacción y por tanto, temperaturas más bajas, de lo habitual. En cualquier caso, ahí van las imágenes y sería interesante que las comparásemos con las otras que tenemos, bien de nuestro instituto o bien las que nos prepararon en la EEZ.





miércoles, 1 de marzo de 2023

El análisis del proyecto por Patri Rodríguez De la Rosa

Los estudiantes de segundo de bachillerato del IES Zaidín Vergeles estamos embarcados en un nuevo proyecto experimental en el cual continuamos trabajando con pimientos. Utilizaremos extractos de los mismos para evaluar su influencia en el crecimiento de Arabidopsis, una planta herbácea que se desarrolla con rapidez y nos permitirá evaluar su crecimiento durante todo el proyecto. Además de los pimientos, también investigaremos el efecto de bacterias como las pseudomonas y sustancias activas como la capsaicina (sustancia que se encuentra en los chiles). Estudiaremos la influencia de estas sustancias en diferentes cantidades, condiciones y variedades de pimientos, incluyendo Alegría Riojana Roja, Alegría Riojana Verde, California Melchor Rojo y California Melchor Verde.

De esta manera, trabajamos por una parte los alumnos en el laboratorio del IES Zaidín Vergeles, que con ayuda de los investigadores preparamos tanto el medio de cultivo (las placas en las que iban a germinar las semillas), como los extractos de las diferentes variedades de pimiento, para finalmente sembrar 10 semillas en cada placa, sellarlas y clasificarlas según su contenido (capsaicina, pseudomonas o variedad del extracto de pimiento).

Por otra parte, los investigadores también realizaron este proceso en la Estación Experimental, lo que será determinante más adelante en cuanto a las condiciones en las que fueron llevados a cabo los mismos procesos.

En la sesión del 13 de febrero comprobamos que una gran proporción de las placas han mostrado una clara contaminación, lo cual se debe en gran medida a las deficientes condiciones de esterilidad presentes en el laboratorio del instituto. En contraste con la Estación Experimental, donde se utilizó una campana para la preparación de las placas, en el laboratorio del instituto se empleó un mechero bunsen que solo crea un campo estéril radial en su entorno inmediato. Además, en cuanto a la conservación, las placas preparadas en la Estación Experimental se mantuvieron completamente aisladas, mientras que en el laboratorio estuvieron más expuestas a muchos alumnos de distintas clases y no se mantuvo una temperatura estable, lo cual contribuyó al proceso de contaminación.

Sin embargo, pudimos observar que la contaminación de las placas no obstaculizaba el desarrollo de la planta. De manera que por el momento deducimos que los hongos no son tan agresivos como para matar la planta, sino más bien un agente externo con el cual ésta tiene que lidiar y adaptarse.

En la última sesión, el 23 de febrero, luego de hacer observaciones detalladas, hemos identificado ciertas discrepancias que nos permiten extraer algunas conclusiones preliminares:

  • A pesar de que las plantas del laboratorio del instituto estaban contaminadas y habían sido sometidas a peores condiciones de cultivo, en comparación con las de la Estación Experimental, su crecimiento ha sido superior. Después de una discusión colectiva, concluimos que esta disparidad se debe a que en el laboratorio del instituto se proporciona una mayor cantidad de luz a las placas. Aparte de las cuatro bombillas que emiten longitudes de onda específicas para el crecimiento de las plantas, también reciben luz natural proveniente de las ventanas y la iluminación regular del laboratorio. Otros factores influyentes son la presencia de una mayor cantidad de CO2, ya que el laboratorio es utilizado por múltiples grupos de estudiantes a lo largo del día, y una temperatura más elevada. En comparación, en la Estación Experimental las placas no están expuestas a tantas personas al mismo tiempo y se mantienen a una temperatura constante, aunque menor.

  • En cuanto a los extractos de pimientos, la presencia del extracto de California Melchor Verde y California Melchor Rojo favorece visiblemente el crecimiento de la planta. De igual modo, la presencia de Alegría Riojana Verde tiene un efecto beneficioso en el crecimiento de la planta, mientras que la variedad Alegría Riojana Roja no muestra el mismo efecto positivo.

  • En el caso de la capsaicina, se aprecia que la presencia de una cantidad baja de capsaicina tiene un efecto beneficioso en el crecimiento de la placa, mientras que una cantidad alta tiene un efecto perjudicial. (Esto se debe a que la capsaicina actúa como un agente antimicrobiano, inhibiendo el crecimiento y la reproducción bacteriana)

  • Respecto a las pseudomonas, han tenido un efecto completamente beneficioso en el crecimiento de la planta. (ya que esta bacteria es una de las principales responsables de la fijación biológica del nitrógeno) 


A partir de las conclusiones obtenidas hasta el momento, es posible formular varias hipótesis que podrían ser objeto de estudio para encauzar el proyecto. Algunas de ellas podrían ser:

  • Al haber observado un contraste entre el efecto causado por los distintos extractos de pimientos (concretamente entre Alegría Riojana Verde y Alegría Riojana Roja)    podríamos estudiar cuáles son las razones detrás de estas diferencias. También podríamos investigar si hay diferencias en la cantidad de nutrientes o minerales presentes en cada variedad de pimiento y si esto tiene algún efecto en el crecimiento de la planta.

  • Las pseudomonas son bacterias capaces de liberar nutrientes del suelo, lo que permite a las plantas obtener los nutrientes necesarios para su crecimiento. Además, estas bacterias también ayudan a prevenir la infección por patógenos, ya que producen compuestos antimicrobianos que inhiben el crecimiento de otros microorganismos. Esto significa que las pseudomonas pueden ayudar a mantener un ambiente saludable para el crecimiento de la planta. A partir de esta información podríamos estudiar la relación entre el efecto beneficioso de las pseudomonas y la presencia de hongos y contaminación en las placas, estudiando hasta cuándo resisten las plantas diferentes cantidades de contaminación.

  • Continuando con las pseudomonas, al demostrar un efecto positivo en el desarrollo de la planta, y teniendo en cuenta que favorecen a las plantas a la hora de obtener nutrientes, podríamos llevar este experimento a la tierra, y comprobar si el efecto de las pseudomonas es aún más beneficioso, determinar si existe una cantidad óptima para el crecimiento y desarrollo de las plantas o si hay alguna relación entre la cantidad de estas sustancias y la producción de clorofila o la formación de raíces por ejemplo

  • ¿Cómo afectan las diferentes condiciones de luz, temperatura y CO2 a la relación entre los extractos de pimiento y el crecimiento de la Arabidopsis?

Los primeros resultados estadísticos

Una vez concluidas las medidas ya tenemos los primeros resultados estadísticos. Se trata de los valores medios de las longitudes de las raíc...